원자 구조 그리는 프로그램 VESTA

VESTA는 전자와 원자의 구조를 시각화해주는 무료 소프트웨어입니다. 특히 결정 구조를 쉽게 그릴 수 있어서 화학, 물리, 공학 등의 분야에서 이용할 수 있습니다. 윈도우, 리눅스, 맥 OS에 호환되는 바이너리 파일을 제공해 설치 없이도 쉽게 사용할 수 있습니다.

이번 포스팅에서는 관련 전공 대학생/대학원생들에게 유용할 만한 소프트웨어 VESTA를 소개하겠습니다.

VESTA란?

VESTA는 Visualization for Electronic and Structural Analysis의 약자로 전자와 원자 구조를 시각화해주는 프로그램입니다. 화학 분야에서 잘 알려진 RASMOL이 주로 고품질의 분자모형을 그리는데 이용된다면, VESTA는 결정 구조의 전자 상태 등을 분석하는데 유용합니다. 마우스 조작으로 물질의 원자 구조를 다양한 각도로 볼 수 있고, 다양한 이미지 출력을 지원합니다. 원하는 원자 구조를 직접 그리는 것은 약간의 지식이 필요하지만, 이전 포스팅에서 알려드린 물질의 데이터 베이스(참조:물질 게놈 프로젝트)를 이용하면 알려진 거의 모든 물질의 원자 구조를 그려 볼 수 있습니다.

다운로드와 사용

VESTA는 공식 홈페이지에서 다운로드 할 수 있습니다.
공식 홈페이지: https://jp-minerals.org/vesta/en/download.html  

위 링크에 가면 라이선스 관련 문장들이 나오는데 조금만 밑으로 내려가면
VESTA의 최신 버전들이 나옵니다.
윈도우, 맥 OS, 리눅스 중 원하는 파일을 선택하여 클릭하면 다운로드가 됩니다.

파일이 ZIP형식으로 압축되어 있으므로 알집 같은 프로그램으로 압축을 풉니다.
압출을 풀면 폴더가 생기는데, 윈도우의 경우 폴더에 들어가서 ‘VESTA.exe’를 클릭하면 바로 사용할 수 있습니다.

다음은 VESTA에서 실제로 그린 SiO₂의원자 구조입니다.

다음 포스팅에서는 실제로 데이터베이스를 이용해서 원자 구조를 그리는 예를 보여드리겠습니다.